अपने स्वभाव से, जैव-कीटनाशक अक्सर प्रथागत कीटनाशकों की तुलना में कम हानिकारक होते हैं। व्यापक स्पेक्ट्रम के विपरीत, पारंपरिक कीटनाशक, जो पक्षियों, कीड़ों और स्तनधारियों जैसे विविध जीवों को प्रभावित कर सकते हैं, वे अक्सर केवल लक्षित कीटों और निकट से संबंधित जीवों को ही प्रभावित करते हैं। पारंपरिक कीटनाशकों द्वारा उत्पन्न पर्यावरणीय चिंताओं को जैव-कीटनाशकों की कार्रवाई से समाप्त किया जाता है, जो बेहद कम मात्रा में काम करते हैं और जोखिम के स्तर को कम करते हैं। एकीकृत कीट प्रबंधन कार्यक्रमों के एक भाग के रूप में उपयोग किए जाने पर उत्कृष्ट फसल पैदावार को बनाए रखते हुए जैव कीटनाशकों में पारंपरिक कीटनाशकों के उपयोग को काफी कम करने की क्षमता